Fatoumata Bathily est la représentante du NIH au Mali et directrice du bureau d’appui à la recherche au Mali depuis 5 ans. En 2016, elle est devenue la double représentante des NIH au Mali et au Sénégal. Avant de rejoindre le NIH/NIAID en 2015, Mme Bathily a travaillé pendant quatre ans au bureau Afrique du Bureau des affaires mondiales (OGA) au sein du Bureau du secrétaire du HHS. Fatoumata Bathily a rejoint HHS en 2008 en tant que « Emerging Leader Fellow » et a travaillé par rotation au sein de la Substance Abuse and Mental Health Services Administration, de l’Office of Refugee Resettlement et de l’OGA. Pendant son séjour à l’OGA, Fatoumata Bathily a effectué une mission TDY en République démocratique du Congo et a travaillé avec l’équipe inter-agences de l’ambassade pour développer et rédiger le plan d’urgence du président pour le plan opérationnel national de lutte contre le sida. Elle était responsable de toutes les réunions d’information du secrétariat et des événements liés aux questions de santé en Afrique à l’OGA. Elle a ainsi pu assurer la liaison avec les agences HHS qui ont des portefeuilles liés à l’Afrique et d’autres départements tels que l’USAID, l’État, le Trésor et le Commerce. Elle a également travaillé avec les ministères de la santé des pays africains pour les aider à mettre en œuvre les objectifs qu’ils ont portés à l’attention du bureau du secrétaire.
Avant de rejoindre HHS, Bathily a travaillé pour une organisation à but non lucratif qui sert les familles sans abri dans la région du Grand Washington, DC, de 2003 à 2006.